Die Freien Jugendherbergen Mecklenburg-Vorpommern sind unabhängig von der Mitgliedschaft als Partner des Deutschen Jugendherbergswerkes und führen den Gästebetrieb in Eigenständigkeit. Träger der Freien Jugendherbergen in Mc-Pom sind entweder Familien oder gemeinnützige Vereine. 

Der Begriff „Jugendherberge“ unterliegt keinem Markenrecht. Diesen Titel führen zu dürfen, sehen die freien Herbergen als Privileg und nicht als Selbstzweck.